袁剑波 研究员

甲壳动物基因组学和进化生物学
研究方向: 甲壳动物基因组学和进化生物学
岗  位: 研究员
部  门: 实验海洋生物学重点实验室
联系方式: 0532-82898786
电子邮件: yuanjb@qdio.ac.cn
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中国科学院海洋研究所研究员、汇泉青年学者,主要从事海洋甲壳动物基因组学和适应性进化生物学的研究,聚焦虾蟹等重要经济型和代表性甲壳动物基因组的破译和特殊生命现象的遗传解析,以及甲壳动物适应性生物学表型的起源演化和分子遗传学基础研究。在Nature Communications、PLoS Biology、Journal of Advanced Research、Reviews in Aquaculture等国际期刊发表论文50余篇,参编专著1部,研究成果获评中国十大海洋科技进展和中科院科技创新亮点成果等。先后主持国家自然科学基金面上项目2项、青年基金项目1项,国家重点研发计划项目子课题2项,崂山实验室科技创新项目子课题1项。个人荣获第一届中国动物学会长隆奖的启航奖(2020年)和山东省海洋科技创新奖的青年海洋科技奖(2022年),作为参与人获得山东省科技进步一等奖等奖励3项。

教育经历

●2009.09-2014.07,中科院海洋研究所,海洋生物学专业,博士学位;

●2005.09-2009.07,电子科技大学,生物技术专业,学士学位。

工作经历

●2023.10 -至今,中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室,研究员;

●2021.12 -至今,中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室,特聘研究员;

●2018.01 -2023.10,中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室,副研究员;

●2017.01-2018.01,中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室,助理研究员;

●2014.07-2017.01,中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室,博士后。

主持或参加主要科研项目情况

1.国家自然科学基金面上项目,42176105,简单重复序列在对虾盐度适应中的功能和调控机制的研究,2022.01-2025.12,58万元,在研,主持;

2. 国际重点研发计划项目子课题,2022YFD2401400,贝虾基因编辑育种关键技术研发与应用,2022.09-2026.12,60万元,在研,主持;

3. 崂山实验室科技创新项目子课题,2022QNLM050101-1,基因组演化与适应性状遗传解析,2022.05-2025.04,50万元,在研,主持;

4. 中国科学院海洋研究所“汇泉青年学者”项目,2021/12-2024/12,50万元,主持,在研;

5. 国家重点研发计划子课题,2018YFD0900404,水产动物营养代谢调控网络构建, 2018.12-2022.12,65万元,结题,主持;

6. 国家自然科学基金面上项目, 41876167, 对虾基因组简单重复序列的爆发与适应性进化研究,2019.01-2022.12, 62万元, 结题, 主持;

7. 国家自然科学基金青年基金项目,41506189,通过比较转录组学和适应性进化分析探索对虾的盐度适应性机制,2016.1-2018.12,21万元,结题,主持。

发表的代表性文章(限10篇)

1. Jianbo Yuan#, Yang Yu#, Xiaojun Zhang, Shihao Li, Jianhai Xiang and Fuhua Li*. Recent advances in crustacean genomics and their potential application in aquaculture. Reviews in Aquaculture. 2023, 1-21.(封面文章)

2. Jianbo Yuan#, Xiaojun Zhang#, Xiaoxi Zhang#, Yamin Sun#, Chengzhang Liu Shihao Li, Yang Yu, Chengsong Zhang, Songjun Jin, Min Wang*, Jianhai Xiang*, Fuhua Li*. An ancient whole-genome duplication in barnacles contributes to their diversification and intertidal sessile life adaptation. Journal of Advanced Research. 2023, doi:j.jare.2023.09.015.

3. Xiaojun Zhang#, Jianbo Yuan#, Yamin Sun#, Shihao Li#, Yi Gao#, Yang Yu#, et al. Penaeid shrimp genome provides insights into benthic adaptation and frequent molting. Nature communications. 2019, 10(356):1-14.(中国十大海洋科技进展)

4. Jianbo Yuan#, Xiaojun Zhang#, Qi Kou#, Yamin Sun, Chengzhang Liu, Shihao Li, Yang Yu, Chengsong Zhang, Songjun Jin, Jianhai Xiang*, Xinzheng Li* & Fuhua Li*. Genome of a giant isopod, Bathynomus jamesi, provides insights into body size evolution and adaptation to deep‑sea environment. BMC Biology. 2022, 20:113.(Spotlight)

5. Jianbo Yuan, Xiaojun Zhang*, Shihao Li, Chengzhang Liu, Yang Yu, Xiaoxi Zhang, Jianhai Xiang and Fuhua Li*. Convergent evolution of barnacles and molluscs sheds lights in origin and diversification of calcareous shell and sessile lifestyle. Proceedings of the Royal Society B. 2022, 289: 20221535.(Nature Index)

6. Jianbo Yuan#, Xiaojun Zhang#, Min Wang#, Yamin Sun, Chengzhang Liu, Shihao Li,Yang Yu, Yi Gao, Fei Liu, Xiaoxi Zhang, Jie Kong, Guangyi Fan, Chengsong Zhang, Lu Feng*, Jianhai Xiang* & Fuhua Li*. Simple sequence repeats drive genome plasticity and promote adaptive evolution in penaeid shrimp. Communications Biology.

7. Jianbo Yuan, Xiaojun Zhang*, Yi Gao, Xiaoxi Zhang, Chengzhang Liu, Jianhai Xiang, and Fuhua Li*. Adaptation and molecular evidence for convergence in decapod crustaceans to deep-sea hydrothermal vent environments. Molecular Ecology. 2020, 29:3954–3969.

8. Zhaoxia Cui#*, Yuan Liu#, Jianbo Yuan#, Xiaojun Zhang#, et al. The Chinese mitten crab genome provides insights into adaptive plasticity and developmental regulation. Nature communications. 2021, 12(2395):1-13.

9. Xiaojun Zhang#, Lina Sun#, Jianbo Yuan#, Yamin Sun#, Yi Gao#, Let al. The sea cucumber genome provides insights into morphological evolution and visceral regeneration. Plos Biology. 2017, 15(10): e2003790. (Nature Index)

10. Jianbo Yuan, Xiaojun Zhang, Fuhua Li and Jianhai Xiang*. Genome Sequencing and Assembly Strategies and a Comparative Analysis of the Genomic Characteristics in Penaeid Shrimp Species. Frontiers in genetics. 2021, 12(658619):1-12.

近5年来出版的专著

1.《The Shrimp Book II》,5m Books,2022。

获得的相关奖励

1. 第一届中国动物学会长隆奖启航奖(个人),2020;

2. 2022年山东省海洋科技创新奖青年海洋科技奖(个人),2022;

3. 山东省科技进步奖一等奖(参与),2022

4. 第十一届大北农科技奖水产科学奖(参与),2019;

5. 海洋科学技术奖二等奖(参与),2019。